却说赵公明奉师命下山自去将颛顼收入门下，悉心教导。此时仓颉经过十数年辛劳，走遍名山大川，并在高明高觉二人的帮助下认识了数不清的奇珍异兽，仰观天文、俯察地理，观沧海横流，识四季变化，明白了天地万物造化的规律。终于造出数以千计，并成体系的文字。仓颉将这些文字整理起来，又创出语法句式，使之简明实用。很快便广传天下，为世人接受。至此，仓颉造字之功终成。
秦华得高明高觉二人传讯，知仓颉功成。急忙下山将仓颉带回流波山，果然天降异像，鬼神夜哭。整个四大部州黑云压城，阴雾弥漫，一片肃杀景象。流波山外围更是惊涛骇浪，山川震动。九重阴云层层叠叠压将下来，遮天蔽日。
秦华在第一时间便全力运转起流波山护山大阵。又将三品莲台取出交于仓颉，令其安坐。一边传讯教中交好的师兄弟前来相助；一边回转洞府，将落宝金钱和刚刚孕育成形的聚宝盆取出。戒备地看着外面的阴云。
其实秦华自己也吃不准到底会发生什么事。外面的阴云虽然声势骇人，但却不像是秦华熟知的任何一种天劫。然而秦华却不敢大意，万一有什么事，到时后悔可就晚了。
却见天边十数道流光闪过，金灵圣母、龟灵圣母带着以秦完为首的金鳖岛十天君赶到了。秦华连忙打开大阵将他们迎进岛内。金灵圣母建秦华等人忧心忡忡，忙说道：“师弟不必担心！我等接到传讯，不敢怠慢，已将此事禀知了掌教师尊。老师叫我转告师弟，这天象乃是人间有变，人情通达于天。引起天地感应所致，并非劫数。安心等候些时日便好！只是仓颉以后便不要随便下山了，只在流波山中潜修便好，以免引起变数。”
秦华听了此言，放下心来。一边热情地招呼各位同门，一边仍然密切注意着外面情形。阴云压顶三月有余，直将流波山遮蔽的日月无光。三月过后，阴云果然渐渐消散，露出蔚蓝的一片天空来。金灵圣母等人也告辞而去。秦华这才放下心思，遂紧闭山门，与几个弟子一起潜修不提。
却说黄帝年事日高，而修行日速。乃传位于其孙颛顼，自采首山铜，于荆山铸九鼎，分镇治下九州气运。鼎成，功德圆满。玉虚宫原始天尊遂命坐下第十二弟子黄龙下界将黄帝接上仙界，成就五帝果位。
黄龙真人领命而去，来到荆山，对黄帝说道：“奉玉虚圣人法旨，因你功德圆满，成就五帝功果，特接你去仙界。”黄帝大喜，翻身上了黄龙之背。余下平常修炼阐教道法的大臣共七十余人，也一并接上天去。其余小臣，纷纷欲上黄龙之身。黄龙真人哪里肯依，摇头摆尾将之推离开去。争执间拽断许多龙髯，落地化为龙须草，黄帝惯常所用宝弓也一并落地。那黄龙见断了龙髯，心中恼怒。顾不得其它，挺身飞腾入高空，眨眼消失不见。（黄帝在道教中的神位为第三神阶左位）
黄帝一生功业颇丰，有黄帝内经、黄帝阴符经、九鼎神丹经、龙首经等许多珍贵经书传世。可谓千秋功业，万古流芳。
黄帝之孙颛顼，二十岁得黄帝传位为人皇。彼时赵公明既为帝师，截教万仙一时再度下山，声势日隆。颛顼在位时，加强各部族间的融合，在截教强大的支持下强令禁绝从洪荒时代、人巫融合之后便一直流传下来的巫教，将许多小部落信奉的神明一概抹去，大力宣扬道门的正统性。颛顼在位78年，死时98岁，子孙众多，得道脱体飞升，并非肉身成圣。
颛顼得道之日，将帝位传于堂侄高辛氏姬喾。那帝喾生于穷桑，少小聪明好学，十二三岁便有盛名，十五而佐颛顼，封有辛地方，三十而得帝位，迁都毫邑，享寿百岁。帝师为人教玄都**师所化的赤松子大仙，在位之时，人才济济，天下大治。
此后尧舜二帝相继而起，兴禅让，行德政，天下敬服。尧严肃恭谨，光照四方，上下分明，能团结族人，使邦族之间团结如一家，和睦相处。且为人简朴，吃粗米饭，喝野菜汤，自然便得到了百姓的爱戴。兴禅让，很好地解决了权力交替之时可能出现的动乱和不满。
舜娶尧二女为妻，受各部族推荐而为帝。增设官吏，知人善任，治下政通人和。设置谏言之鼓，让天下百姓尽其言；立诽谤之木，让天下百姓攻击他的过错。治天下五十余年，却终于在他为帝期间发生了一件危及天下百姓生死存亡的大事件，滔天的洪水暴发了。
却说三教各做了一次帝师，尧舜之时，却没有再从道门修士中选出帝师来。只是三教修士常往来四大部州，在人族中传道授徒，宣扬道法。巫教既灭，道门正统地位无可撼动，香火日盛一日。
至巫妖大战之后，洪荒数百万妖族全部避居北俱芦洲。一时高手俱失，许多强大的法门神通不是随着大战消失，便是被带到了隐居之地。导致三大部州妖族一蹶不振。数万年来，北俱芦洲之外新生的小妖都只能修到妖王境界。所有的妖族也都认为妖王便是妖修的最高境界了。
这些妖族盘踞深山，划分地盘。因巫族与人族融合，秉持了巫妖血仇的新生妖族们便不断骚扰人族部落。人族在巫师们的带领下，也不断剿灭妖族。双方仇怨越积越大，普通人族对妖怪渐渐形成了恐惧和厌恶的心理，可说闻妖色变。
当然，也有妖族仗着变化之术混迹人间，普通人族也辨认不出。以其神通法术，一概认为神仙，享受了一些人间香火。
却说前时巫族支持的蚩尤争帝失败身死，后刑天、风伯、雨师等人相继被道门打压。及至颛顼之时，强废巫教，巫师地位一落千丈，终于引起巫族所有大神者的不满。
祖巫殿剩余大巫以血祭的方式将此事告知囚禁在无涯山的祖巫共工。共工大怒，遂发洪水于天下，以警世人。共工本意不过惩戒一番，聊以示威耳。奈何其本身神通广大，散落人间各个幽暗角落的妖族又不断兴风作浪，普通巫师也趁机推波助澜，发泄心头怨气。竟使得这场洪水声势越发浩大，越演越烈，渐渐不可收拾。
道门三教本来见祖巫发怒，心下也确实有愧。起先便也听之任之，任由洪水泛滥。但见大水经久不息，百姓流离失所，苦不堪言，终于也忍不住了。三教圣人同时发旨，命弟子下山相助人皇治理洪水。又遣相继警告共工，令其安分守己，莫要再造罪孽。共工不过一时愤怒，听了圣人言语，自然收手。
然而洪水滔天之势已成。源头虽断，洪水一时却仍然无法消退。一时间，三教各显神通，巫妖并逞手段。三界再次热闹起来。