最艰难的部分，船开始在海面行走，世界并没有就此安宁下来，暴雨倾盆，闪电雷鸣，象征着接下来的动荡，不过，接下里就简单多了。
当暂时安全的消息被通告后，船内的人欢欣鼓舞着。
接下来的日子里，方舟在狂风暴雨中行走，在这个过程中解救了很多的逃生船，方舟上的人口再次得到增加，逃生船也得到回收。
船内的人已经登记完毕，管理层人员开始对人员进行管理分配，统计人口，和分配工作等安排。
在狂风暴雨中度过了数月，通过卫星显示，这个世界已经没有了陆地，人类从今之后就只能生活在方舟之上，在人员规划完毕之后，九艘方舟也开始了规划。
住宅，生产，行政，研究每一艘都进行了分化，到目前为止大家都很配合，没有反对意见，新的政治结构也已经完成，联合主席成为方舟主席，其余首脑占据了方舟的一些实权位置，帝和尊皇以副主席的身份名列统治阶层却没有任何的实权。
数月之后，暴风雨终于停歇，世界再次迎来了曙光，人们跑到甲板上，欢呼着，笑闹着，脸上是劫后余生的喜悦，他们还活着，有人痛苦，为了在这次灾难中死去的亲朋好友。
主席再说了些安抚和庆祝的话语，人类正式开始了新的生活。
九艘方舟连载一起，形成了一个圆环，每艘船都有几个甲板连接作为痛苦，环形的中间构造了一个钢铁城市，被誉为中央区的商贸场所，这样，就形成了方舟之城。
除了这九艘船外，还有其他他的船只在外围，那是私人所属或者军队的船只，为了捕鱼，还有探知危险。
有了帝提供的两项技术，人类的食物危机解除，足以满足人类的温饱，但是绝对不能想以前那样不限量，整个方舟都进入了计划使用的社会情况，每个人限量。
时间慢慢过去，在浩劫过后的人们就这样过了一年。
这一年里，在末日动荡过的心已经完全消失，普通阶层开始抱怨，食物的不丰富，不足够，每天辛苦的工作只有一点点的东西，对于上层的不满开始有游行出现，口号是自由，公正，人权。上层对于普通阶层的不知足也分外不满，两者之间的矛盾开始出现。
下层暴动，上层强硬处决，矛盾激化，慑于上层的武力，下层只能失败，接受命运。也是从那之后，上层成为了真正的特权阶级，理所当然的享受着一切奢侈，上层有各国首脑，和掌握着大量现在流通金属的黄金的富豪们。而下层则是以往的平民和被救上船的难民。
上层以保护者，施舍者之姿面对下层，下层畏惧上层，认为上层吸食下层的血肉。上层看不起下层，下层憎恨上层，这就是现在的双方的情况。
而就在最近，一个反抗上层名为解放者的组织出现，它得到了下层的拥护，上层的震怒追捕，但是这个组织明显很有计划，也很有水平，而且它们拥有武器和上层的军队对抗。
帝看着解放者领导着的会面，其中就有数人，在政府工作，娶了一个名门小姐的肯，还有那个正义感十足的韦尔。
肯的英俊经过磨砺，越发沉稳，难怪会迷倒那位千金，而韦尔的经历，帝也清楚，警察的工作让韦尔接触了很多阴暗面，对于自己的工作越来于迷茫，终于在一次任务中杀了反对上层而游行的前妻男朋友，得到了来自孩子和前妻的憎恨，要知道他们的生活靠着那个男人的支撑。是愧疚，是悔恨，这个男人终于爆发了对上层的不满，和肯这个野心勃勃的男子联合了起来，暗地里发展出了解放者着组织。
肯是为了野心，韦尔是真的想要就所有人的救世主心态。